GD从版本2.0.29 开始支持生成gif动画,估计php应该很快就会添加该方面的函数。
纯php实现(GIF images into animated GIF with native PHP class)
http://www.phpclasses.org/browse/package/3163.html

一个PHP补丁,需要GD2.0.29 以后(Animated GIF output for PHP)
http://hyvatti.iki.fi/~jaakko/sw/

一个GIF处理库gifsicle
http://www.lcdf.org/gifsicle/

强大的图形处理库ImageMagick
http://www.imagemagick.org/